Total Commander popularan je program koji je svoju slavu stekao jednostavnošću korištenja, velikim brojem dodataka i prisutnošću jedinstvenih postavki koje nisu dostupne u većini drugih upravitelja datoteka. Ipak, Total Commander ima niz alternativnih programa koji nemaju ništa manje funkcionalnosti i mogu biti dobra zamjena.
FAR menadžer
Jedna od najpopularnijih alternativa Total Commanderu je FAR Manager. Ovaj program ima sličan skup funkcija, ali se razlikuje po sučelju i nekim značajkama. Kao i Total Commander, aplikacija ima velik broj dostupnih dodataka koji će pomoći poboljšati funkcionalnost i najzahtjevnijeg korisnika. Što se tiče niza opcija, FAR ne zaostaje za svojim kolegama, apsolutno je besplatan i aktivno ga razvija zajednica programera. FAR ima slično sučelje s dva okna, implementirano u tekstualnom formatu, što upravitelja datotekama čini jednostavnim za upotrebu i brzim radom čak i na slabim računalima.
FAR također ima teme, a funkcijama programa može se u potpunosti upravljati s tipkovnice.
FreeCommander
FreeCommander besplatna je alternativa Total Commanderu. Kao i njegov prethodnik, FreeCommander ima višejezično prilagodljivo sučelje i širok raspon postavki. Značajka programa je sposobnost pokretanja s flash pogona kao prijenosne verzije u bilo kojem sustavu Windows. Aplikacija je brza, ima mogućnost pregleda arhiva u običnom tekstu te u heksadecimalnom i binarnom formatu. Za razliku od FAR-a, uslužni program podržava Drag & Drop i može se povezati s udaljenim FTP poslužiteljima. FreeCommander je sposoban postati potpuna alternativa Total Commanderu.
Nedostatak FreeCommandera je nedostatak sustava modula i sposobnost integriranja vlastitih proširenja.
Imenik Opus
Directory Opus je plaćeni upravitelj datotekama s višenamjenskim sučeljem koji će biti dobar pomoćnik u radu s raznim datotekama. Kao i Total Commander, aplikacija ima višejezično sučelje, mogućnost promjene dizajna pomoću nekoliko gumba. Program ima napredniju funkciju filtriranja i pretraživanja datoteka, sposoban je sinkronizirati podatke, tražiti duplikate u sustavu. Directory Opus ima velik broj dodataka, kojih međutim nije toliko puno u usporedbi s FAR-om ili Total Commanderom. Program je sposoban za automatsko ažuriranje i dostupan je za 32 i 64-bitne Windows arhitekture. Aplikacija se također može pokrenuti s USB bljeskalice.
Ostale mogućnosti uključuju aplikaciju Double Commander s podrškom dodatka od ukupnog zapovjednika. Tu su i Unreal Commander i Speed Commander, koji praktički ponavljaju funkcionalnost Total Commandera, ali imaju malo drugačiji dizajn i stablo postavki.